Ο Απόλλων Καλαμαριάς είναι ένα ιστορικό σωματείο που αντλεί τις ρίζες του από τον Πόντο. Το ποδοσφαιρικό του τμήμα δημιουργήθηκε το 1926, όταν και μετά την βίαιη μεταστέγαση των δικαιωμάτων του Απόλλωνα στην Καλαμαριά, ο τότε πρόεδρος Εμμανουήλ Μαγιόπουλος δημιούργησε την ομάδα.

Το έμβλημα με τον Θεό Απόλλωνα πρόεκυψε από τους πρόσφυγες εθελοντές που βοηθούσαν την περιοχή και είχαν στις φανέλες τους κεντημένο το κεφάλι του. Το κόκκινο χρώμα είναι για το αίμα χιλιάδων προσφύγων, που σφαγιάστηκαν στον Πόντο και μαύρο χρώμα, ως ένδειξη αιώνιου πένθους για τους συγγενείς, τα όνειρα και τις πατρίδες που ξεριζώθηκαν.

Έχει αγωνιστεί πολλά χρόνια στην Α’ Εθνική κατηγορία, με τελευταία συμμετοχή τη σεζόν 2007-08, όπου υποβιβάστηκε λόγω της υπόθεσης Βάλνερ.